1988年县改区后，原区公所改为办事处。是年，全区有9个办事处，10个镇，35个乡，627个村，2个区属场。

　　1989年撤销谢家铺乡，设立谢家铺镇。

　　1991年撤销灌溪乡，设立灌溪镇。

　　1992年撤销蔡家岗乡，设立蔡家岗镇。

　　1993年撤销韩公渡乡，设立韩公渡镇。

　　1994年撤销洞庭乡、中河口乡，设立十美堂镇、中河口镇。

　　1995年11月，全区撤处并乡。撤销蒿子港、石公桥、大龙站、河洑、牛鼻滩、斗姆湖、石门桥、黄土店、港二口9个办事处。保留武陵镇、蒿子港、中河口、十美堂、镇德桥、牛鼻滩、灌溪、蔡家岗、斗姆湖、黄土店10个镇和黄珠洲、黑山嘴、大龙站、双桥坪、长岭岗、石板滩、雷公庙、丁家港、草坪、唐家铺、沧山、钱家坪、港二口、尧天坪、长茅岭及许家桥回族维吾尔族民族乡等17个乡。将冲天湖并入石公桥镇，瓦屋垱乡并入周家店镇，断港头乡并入韩公渡镇，康家吉乡并入石门桥镇，赵家桥乡、官桥坪乡并入谢家铺镇，肖伍铺乡并入白鹤山乡。撤处并乡后，全区原9个办事处及40个乡镇变更为33个乡镇。同年11月，撤销草坪乡、港二口乡，设立草坪镇、港二口镇。

　　1996年5月，将谢家铺的12个村划归石门桥镇;周家店的李家桥村和大龙站乡的富贵坡村一组划归区园艺场;韩公渡的3个村划归常德特种养殖总场。同时，撤销大龙站乡、尧天坪乡，设立大龙站镇、尧天坪镇。

　　1996年9月，撤销双桥坪乡，设立双桥坪镇。

　　1997年12月，撤销雷公庙乡，设立雷公庙镇。

　　1998年5月，撤销石板滩乡，设立石板滩镇。同年12月，逆江坪乡高岩塘村泉水洞划归花岩溪旅游度假区。

　　2003年全区共22个镇，11个乡，4个农林场，74个居委会，563个村委会，6696个村民小组。

　　2014年1月，撤销鼎城区武陵镇，设立玉霞、红云、郭家铺3个街道。

　　撤销斗姆湖镇，设立斗姆湖街道。

　　2015年11月，全区乡镇行政区划调整，十美堂镇、黄珠洲和黑山嘴2个乡成建制合并设立十美堂镇，长岭岗乡和蔡家岗、雷公庙2个镇成建制合并设立蔡家岗镇。双桥坪镇和大龙站镇成建制合并设立双桥坪镇，尧天坪镇和长茅岭乡成建制合并设立尧天坪镇，谢家铺镇和唐家铺乡成建制合并设立谢家铺镇，沧山、钱家坪2个乡和黄土店镇成建制合并设立黄土店镇，港二口镇和逆江坪乡成建制合并设立花岩溪镇，许家桥回族维吾尔族乡和丁家港乡成建制合并设立许家桥回族维吾尔族乡。蒿子港、中河口、牛鼻滩、灌溪、韩公渡、周家店、石公桥、镇德桥、石板滩、草坪不作调整。

　　2016年4月，全区合乡并村后，共有18个乡镇，4个农林场，4个街道办事处，76个居委会，226个村委会，2898个村民小组。